У меня пропала значок добавления статей на фронтэнде сайта и верхние фильтры

Ви редактировали файл шаблона статьи?

или возможно проблемы с шаблоном Joomla у меня на шаблоне Omegatheme Shirt пропадают все кнопки кобальта при наведении курсора на них а после перезагрузки страницы появляются

Настпройки этой кнопки в настроках шаблона основной разметки. Так же попробуйте включить соместимость шаблонов в основных настроках кобальта.

По моему все велючено

В другой теме ответил.